資訊處於105學年度舉辦22場臨床資料庫分析暨生醫軟體教育相關訓練

資訊處為推廣臨床資料研究,強化校內師生生醫資料分析能力,於105學年度期間舉辦了12場臨床資料庫推廣活動,及10場研究資料相關軟體課程,平均每月辦2場教育訓練,以提昇一校三院的學術研究能量。

資訊處除邀請元智大學資訊工程學系李宗夷教授及國立中央大學系統生物與生物資訊研究所吳立青副教授分享生醫研究經驗,以增進跨領域學術交流。此外,在生醫資訊軟體部分,更藉由舉辦多場Ingenuity Pathway Analysis、CLC Genomics Workbench、SYBYL、SAS EG、SAS EM等相關軟體課程,讓使用者能熟悉,並進一步運用軟體對本校各項資料庫進行研究分析。【圖:2017年5月李宗夷教授授課情形】

本校生醫大數據資料的建置,包含:臨床資料庫與基因體(Omics)資料庫兩個面向。「臨床資料庫」蒐集彙整北醫附醫、萬芳醫院、雙和醫院三院的臨床資料,並整理建置成為資料庫,透過資料去識別化與防火牆的建置,再利用虛擬桌面基礎架構(virtual desktop infrastructure, VDI)與管理規則制定,提供使用者資料分析圖形化介面操作,進而完成兼具效率性與安全性的臨床資料分析平臺。目前一校三院已有多件臨床研究案進行中,並有許多醫師提出臨床問題諮詢,顯示出此研究方向的重要性。【圖:2016年11月吳立青副教授分享情形】

在「基因體資料庫」建置方面,北醫大為提供體系內使用者方便且快速取得癌症研究相關資料,藉由癌症基因體圖譜計畫(TCGA)所蒐集之特定癌症病患的相關臨床記錄、腫瘤組織及相對應正常組織的定序與相關檢測資料,建置了TCGA臨床資料檢索與篩選平臺,整合相關資料與分析結果,提供瀏覽下載及進行生物資訊協作分析,目前已建置6種癌症樣本(結腸、直腸癌、膽管癌、肝癌、腦腫瘤)的臨床資訊與基因體資料,將有助於癌症研究之預防、診斷與治療。若想更了解研究資訊軟體或臨床資料概況,歡迎與資訊處研究資訊組聯繫。(文/資訊處研究資訊組)【圖:2017年5月CLCbio課程,由研究資訊組組員為參與者說明】

由 joycechin 發表於 September 14, 2017 03:48 PM | 發表意見於FB
收藏此文: 加入Google書籤 網路書籤

« 萬芳醫院以熱療合併化療及標靶藥物,有效控制再發腫瘤 | 回到電子報首頁 | 北醫大反思寫作中心舉辦跨校「反思寫作融入課程教學規畫工作坊」 »